多聚核糖體分析（Polysome Profiling）

技術(shù)簡介

基因表達在多個層面上受到調(diào)控，包括：表觀遺傳水平調(diào)控、轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控、翻譯水平調(diào)控以及翻譯后修飾調(diào)控。其中，翻譯調(diào)控控制著蛋白質(zhì)的生物合成以響應(yīng)生理和病理的變化。而且，翻譯水平的調(diào)控也深刻影響了蛋白質(zhì)的豐度。研究翻譯水平的調(diào)控機制，有助于深入理解基因表達調(diào)控機制，并且可以解釋轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組分析之間的差異。

多聚核糖體分析（Polysome profiling）是研究翻譯調(diào)控機制常用的技術(shù)。Polysome profiling通過蔗糖密度梯度超速離心分離free mRNA、40S和60S核糖體亞基、單核糖體和多聚核糖體，收集含有多聚核糖體的部分用于RNA或蛋白質(zhì)分析。也可以通過酶消化檢測disome。

Polysome profiling既可用于特定mRNA的靶向分析，也可用于整體分析。相對于Ribo-seq來說還可以獲得全長翻譯的mRNA，包括非翻譯區(qū)（UTRs），而UTRs含有調(diào)節(jié)選擇性翻譯的順式作用元件。鑒定與翻譯的mRNA亞型相對應(yīng)的UTRs和保守的順式作用元件對于基因表達調(diào)控的機制分析至關(guān)重要。此外，多聚體分析可以與免疫印跡或蛋白質(zhì)組學(xué)相結(jié)合，來監(jiān)測與核糖體或起始復(fù)合物相關(guān)的蛋白質(zhì)。最后，多聚體圖譜分析特別適用于缺少基因組數(shù)據(jù)或不可能進行基因操作的模式生物。